Hiciste lo correcto al hacerla ver a los ojos, no te preocupes. Tal vez eso es lo que se necesitaba para evitar que tomara sus acciones por sentado.
Si se supone que ella debe caer en la categoría de “buen amigo”, estoy bastante segura de que entenderá sus sentimientos. Dale algo de tiempo para que corresponda (uno efectivo y lógico) siempre que no lo haya hecho antes de que pienses en acercarte a ella nuevamente. Y si ella toma esto demasiado al corazón y reacciona agresivamente, tendría que decir que es mejor dejarla en paz para que entienda su culpa y espere que lo haga.